現今，工業管道清洗主要有管道、管束和容器內壁三大類。工業管道清洗因垢層厚且硬，管線又長，所以清洗難度也就越大。
高壓水射流清洗機在對工業管道清洗時主要有兩個方面，第一是對大功率泵機組的要求，第二是對噴頭的要求。
例如中國氧化鋁業管道化的清洗需求量很大，幾年來對高壓水射流清洗機功率的要求從350kw提高到550kw、壓力達到1500bar，流量甚至要求220L/min。其主要原因是管道化垢層又厚又硬，導致清洗量大、清洗周期短。清洗管道垢層業內的叫法稱為除結疤，由于作業現場高壓軟管要在150m以上，所以壓力損失也相對較大。
由于高壓水射流清洗機清洗工業管道時依靠超高壓大流量水射流驅動噴頭前行，所以根據不同的管道直徑又設計出多種噴頭。而旋轉噴頭的技術性要求很強，轉速太快則會導致水射流霧化，轉速太慢又容易卡死。所以，旋轉噴頭的設計都要考慮減速。
高壓水射流清洗機清洗工業管道的原理是利用噴頭前部的旋轉高壓水射流將管道內壁上的積垢切割粉碎，再由噴頭后部的高壓水射流將污垢排出，向后噴射頭產生的反作用力用于將噴頭和高壓軟管向前推進。當噴頭達到管道的另外一端時，可以適當的減小壓力。而后高壓軟管在卷管器拉力的作用下被強制后移，從而進一步的清洗管壁，并將剩余的雜物帶到管外，以達到清洗管道的目的。